Подробно в ролике!
Короновирусы — это оболочечные вирусы с однонитчатой позитивной РНК, которые относятся к семейству Coronaviridiae, отряду Nidoviridae. Различают четыре генерации короновирусов:
- α -коронавирусы
- β -коронавирусы
- γ -коронавирусы
- δ -коронавирусы
Грызуны и летучие мыши являлись источниками генов для α — и β -коронавирусов, а птицы — для γ — и δ -коронавирусов. Короновирусы (CoV) легко преодолевают межвидовые барьеры. Ученые считают, что в какой-то момент CoV перескочили от животного к человеку. Один из таких скачков мы наблюдаем сейчас на примере пандемии COVID-19.
Строение возбудителя COVID-19
Однонитчатая РНК
Новый коронавирус на 83% идентичен своему предшественнику, возбудителю SARS. В составе его РНК находится информация о белках:
- Две трети (66%) занимает информация о неструктурных белках (nsp — «non-structural proteins «), учавствующих в процессах воспроизведения вируса
- Одна треть — это гены, кодирующие структурные белки. Они представлены спайк(S ), мембранным (M ), оболочечным (E — «envelop «) протеинами. Внутри находится один нуклеокапсид (N ), связанный с РНК
- Некоторая часть генома зарезервирована информацией о дополнительных белках. Некоторые из них, например orf3, уникальны для SARS-CoV-2 (читай ниже)
Неструктурные белки
Протеин
Функция
nsp1 Подавляет имунный ответ клетки хозяина (антагонист интерферона) nsp2 Неизвестна nsp3 Предпологаемый PL-pro (папаин-подобная протеаза) домен.
Обратите внимание: За последние сутки в России выявлено 13868 новых случаев коронавируса в 85 регионахИз них 28,1% не имели клинических.
Может связывать РНК с коплексом репликаза/транскриптаза nsp4 Трансмембранные строительные леса для ремоделирования клеточной стенки nsp5 Главная протеаза (3С-подобная протеаза) nsp6 Таже, что и nsp4 nsp7 Формирует огромный комплекс с nsp8 nsp8 В комлексе с nsp7 может играть роль зажима для RdRp (смотри nsp12 ) nsp9 РНК-связывающий протеин nsp10 Zn-связывающий кофактор для nsp16 nsp11 Короткий пептид в конце orf-1 nsp12 RdRp (RNA-dependent RNA polymerase ) — РНК-зависимая РНК-полимераза nsp13 РНК-хеликаза, РНК-5′-трифосфатаза nsp14 N7-метилтрасфераза, EXO N 3`-5` экзонуклеаза (проверяет последовательность нуклеотидов для полимеразы) nsp15 Уридил-эндонуклеаза (разрезает связи вокруг уридила для формирования циклических фосфатов) nsp16 2`-O-метилтрансферазаСтруктурные белки
К структурным белкам относится нуклеокапсид (N) — единственный внутренний структурный протеин. Он связан с РНК формируя рибонуклеиновый комплекс — своего рода каркас, придающий нужную форму и оберегающий РНК. Он также взаимодействует с остальными белками, принимая участие в воспроизведении.
Нуклеокапсид тормозит жизненный цикл клетки-хозяина
Спайк (S) протеин придает вириону характерную форму солнечной короны при криомикроскопии. Распологаясь на оболочке, его функцией является связь с клеткой организма человека и проникновение вируса внутрь. Состоит из двух субъедениц (S1 и S2 ), которые становятся самостоятельными при разрыве мостика фуриновой протеазой клетки хозяина.
S1 субъединица связывается с ангиотензин-превращающим-ферментом 2 (АПФ 2). АПФ 2 — это поверхностная, цинк-связывающая пептидаза, играющая огромную роль в регулировании артериального давления и функции сердца. АПФ 2 находится на мембранах клеток многих органов, в том числе легочных эпителиальных клеток.
S2 субъединица отвечает за пенетрацию клетки хозяина, которая происходит путем слияния двух оболочек.
Мембранный (M) протеин пожалуй единственный, который можно действительно назвать структурным — он придает характерную кривизну мембране и отвечает за ее стабильность. Это преобладающий мембранный белок.
Оболочечный (E) протеин располагается гораздо реже (до 20 на вирион) на липидной оболочке, пронизывая всю ее толщу — E-протеин является транмембранным ионным каналом. Обладает низкой активностью и считается неэссенципльным белком.
Дополнительные белки
orf3b является уникальным протеином нового коронавируса, гомологов которого не найдено в его предшественнике. Предполагают, что он играет важную роль в патогенности нового вируса, угнетая интерферон-β.
orf8 — интересный протеин, структура которого постоянно меняется, а вот сама функция его пока не ясна.
Больше интересных статей здесь: Мир.
Источник статьи: Строение нового коронавируса. Анатомия убийцы. Структура SARS-CoV-2.